ศูนย์เชี่ยวชาญเฉพาะทางด้านจุลชีววิทยาเชิงระบบ
อาจารย์ผู้รับผิดชอบ
- ศ.ดร.สัญชัย พยุงภร [หัวหน้าศูนย์]
- รศ.สพ.ญ.ดร.อัญญรัตน์ ต้นธีรวงศ์
- ผศ.ดร.พญ.สุวัชรีพร โรจน์ชีวพันธ์
- อ.ดร.นพัต จันทรวิสูตร
- อ.ดร.พรชัย แก้วทรัพย์ศักดิ์
รายละเอียด/เป้าหมายของศูนย์
ศูนย์เชี่ยวชาญเฉพาะทางด้านจุลชีววิทยาเชิงระบบ ภาควิชาชีวเคมี คณะแพทยศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย มีเป้าหมายในการศึกษาอณูชีววิทยาของเชื้อจุลชีพแบบองค์รวม เพื่อให้ได้องค์ความรู้ใหม่ ยกระดับงานวิจัยขั้นสูงทางด้านจุลชีววิทยาเชิงระบบ และผลิตผลงานวิจัยที่มีมาตรฐานระดับนานาชาติ ตลอดจนสร้างสรรค์นวัตกรรมทางการแพทย์ในการตรวจวินิจฉัย ป้องกัน และรักษาโรคติดเชื้อในคนและสัตว์ ทั้งนี้หน่วยปฏิบัติการจุลชีววิทยาเชิงระบบ ประกอบด้วย 4 สาขา ดังนี้
- Metagenomics มีเป้าหมายในการระบุและจำแนกเชื้อจุลชีพชนิดต่างๆ เพื่อให้เกิดองค์ความรู้ในด้านชนิด ปริมาณ และความหลากหลายทางชีวภาพของเชื้อจุลชีพ ที่พบในคน สัตว์ และสิ่งแวดล้อม
- Microbial Genome มีเป้าหมายในการศึกษายีนและจีโนมของเชื้อจุลชีพ เพื่อให้เกิดความเข้าใจ เกี่ยวกับบทบาทของยีนในเชื้อจุลชีพที่เกี่ยวข้องกับลักษณะต่างๆ เช่น ความรุนแรงในการก่อโรค และความสามารถในการดื้อยา เป็นต้น
- Microbes & Host Response มีเป้าหมายในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ในระดับอณูชีววิทยาระหว่างเชื้อจุลชีพและโฮสต์ เพื่อให้เข้าใจกลไกการก่อโรคของเชื้อจุลชีพ และกลไกการตอบสนองของโฮสต์ ซึ่งจะนำไปสู่การพัฒนาวิธีการป้องกัน และรักษาโรคแบบใหม่
- Pathogens Diagnosis มีเป้าหมายในการประยุกต์ใช้เทคนิคทางด้านอณูชีววิทยา เพื่อพัฒนาชุดตรวจคัดกรอง และชุดตรวจวินิจฉัยเชื้อจุลชีพก่อโรคในคน สัตว์ และสิ่งแวดล้อม ได้อย่างจำเพาะ แม่นยำ รวดเร็ว และมีราคาถูก
ผลงานวิจัยและนวัตกรรมที่โดดเด่น
- COVID-19 SCAN: An Innovative, Proactive, Fast, Accurate, and Affordable Screening Kit
- Sawaswong V, Chanchaem P, Klomkliew P, Rotcheewaphan S, Meesawat S, Kemthong T, Kaewparuehaschai M, Noradechanon K, Ekatat M, Kanitpun R, Srilohasin P, Warit S, Chaiprasert A, Malaivijitnond S, Payungporn S. Full-length 16S rDNA sequencing based on Oxford Nanopore Technologies revealed the association between gut-pharyngeal microbiota and tuberculosis in cynomolgus macaques. Sci Rep. 2024 Feb 10;14(1):3404.
- Sivapornnukul P, Khamwut A, Chanchaem P, Chusongsang P, Chusongsang Y, Poodeepiyasawat P, Limpanont Y, Reamtong O, Payungporn S. Comprehensive analysis of miRNA profiling in Schistosoma mekongi across life cycle stages. Sci Rep. 2024 Jan 29;14(1):2347.
- Nimsamer P, Sawaswong V, Klomkliew P, Kaewsapsak P, Puenpa J, Poovorawan Y, Payungporn S. “Nano COVID-19”: Nanopore sequencing of spike gene to identify SARS-CoV-2 variants of concern. Exp Biol Med (Maywood). 2023 Oct;248(20):1841-1849.
- Chitcharoen S, Phokaew C, Mauleekoonphairoj J, Khongphatthanayothin A, Sutjaporn B, Wandee P, Poovorawan Y, Nademanee K, Payungporn S. Metagenomic analysis of viral genes integrated in whole genome sequencing data of Thai patients with Brugada syndrome. Genomics Inform. 2022 Dec;20(4):e44.
- Mayuramart O, Poomipak W, Rattanaburi S, Khongnomnan K, Anuntakarun S, Saengchoowong S, Chavalit T, Chantaravisoot N, Payungporn S. IRF7-deficient MDCK cell based on CRISPR/Cas9 technology for enhancing influenza virus replication and improving vaccine production. PeerJ. 2022 Sep 21;10:e13989.
- Saengchoowong S, Nimsamer P, Khongnomnan K, Poomipak W, Praianantathavorn K, Rattanaburi S, Poovorawan Y, Zhang Q, Payungporn S. Enhancing the yield of seasonal influenza viruses through manipulation of microRNAs in Madin-Darby canine kidney cells. Exp Biol Med (Maywood). 2022 Aug;247(15):1335-1349.
- Anuntakarun S, Sawaswong V, Jitvaropas R, Praianantathavorn K, Poomipak W, Suputtamongkol Y, Chirathaworn C, Payungporn S. Comparative genome characterization of Leptospira interrogans from mild and severe leptospirosis patients. Genomics Inform. 2021 Sep;19(3):e31.
- Mayuramart O, Nimsamer P, Rattanaburi S, Chantaravisoot N, Khongnomnan K, Chansaenroj J, Puenpa J, Suntronwong N, Vichaiwattana P, Poovorawan Y, Payungporn S. Detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 and influenza viruses based on CRISPR-Cas12a. Exp Biol Med (Maywood). 2021 Feb;246(4):400-405.
- Samacoits A, Nimsamer P, Mayuramart O, Chantaravisoot N, Sitthi-Amorn P, Nakhakes C, Luangkamchorn L, Tongcham P, Zahm U, Suphanpayak S, Padungwattanachoke N, Leelarthaphin N, Huayhongthong H, Pisitkun T, Payungporn S, Hannanta-Anan P. Machine Learning-Driven and Smartphone-Based Fluorescence Detection for CRISPR Diagnostic of SARS-CoV-2. ACS Omega. 2021 Jan 20;6(4):2727-2733.
แกลเลอรี่
